Der Direktor des Steiermärkischen Landesarchivs regt eine Teilung der Sammlung des BTA inklusive einer Zuordnung von Personal und Sachbudget an. In einer neuen Geschäftseinteilung des Amtes der Landesregierung finden sich dessen Agenden bereits dem Landesarchiv zugeordnet. Das Kuratorium des Joanneums lehnt dies aber ab: „Das Joanneum ist mit seinen 17 Sammlungen im Sinne des Stiftungsgedankens ein unverwechselbares Universalmuseum. Es wäre ein grober Fehlgriff, ausgerechnet im Übergang zu einer neuen Organisationsform mit seiner Demontage zu beginnen.“

Ein Beschluss der Steiermärkischen Landesregierung vom 2.7.2001 schreibt die Übertragung der Führung des Landesmuseums Joanneum mit 1.1.2003 an eine gemeinnützige GmbH vor. Demnach wird ein Bild- und Tonarchiv im Department Kunstgeschichte im Landesmuseum eingerichtet.

Der Landesrechnungshof verurteilt die wiederholt „vorgebrachten Zweifel an der Existenzberechtigung“ des Bild- und Tonarchivs. Eine Eingliederung in das Landesarchiv, aber auch die Übernahme der Fotosammlung des Landesarchivs in das Bild- und Tonarchiv werden als Entwicklungsmöglichkeiten genannt.

Weiters fordert der Rechnungshof eine prinzipielle Entscheidung, ob der Ton-/Film- und Videobereich aufrechterhalten bleiben soll.

Nachdem Barbara Schaukal die Abteilung interimistisch seit 1998 geführt hat, wird Petra Ellermann-Minda als neue Leiterin eingesetzt.
Mit IMDAS-Pro wird eine neue Datenbanksoftware zur Sammlungserschließung installiert. Zugleich mit Neueingaben wird an der Korrektur und Ergänzung der Datensätze aus den früheren Versionen der Datenbank gearbeitet, parallel dazu mit einer Sammlungsqualifizierung begonnen.
Von historischen Tonbandaufnahmen im Altbestand werden routinemäßig Sicherungskopien auf DAT-Kassetten hergestellt.

Das im sogenannten Ecksaal beheimatete Büro der Erinnerungen wird Teil des Bild- und Tonarchivs und realisiert bis 2010 diverse partizipative Buch- und Ausstellungsprojekte.

In der Ausstellung © Elfie Semotan wird erstmalig eine umfassende Personale der wohl wichtigsten zeitgenössischen Modefotografin Österreichs gezeigt.

Als Beitrag zum Gedankenjahr 2005 bietet das Bild- und Tonarchiv mit „Wo keine Steiermark, da kein Österreich“ einen kritischen Blick auf die steirische/österreichische Gesellschaft nach 1945. Im Zusammenspiel von zeitgenössischen Textzitaten und Fotografien aus den eigenen Beständen wurde in einer möglichen Bildergeschichte die Entwicklung von einer wieder berufenen steirischen zu einer österreichischen Identitätskonstruktion in den Jahren 1945–1959 nachgezeichnet.

steht im Zeichen der konservatorischen Zustandsqualifizierung des Sammlungsbestandes durch den Fotorestaurator Andreas Gruber. Rund 625.000 Fotonegative und -positive werden in archivgerechte Hüllen und Ordnerkassetten verbracht, Zwischendepots für Sammlungsgut und ein Manipulationsraum für die Arbeit mit belastetem Fotomaterial eingerichtet.

In der Datenbank IM DAS-Pro sind über 70.320 Datensätze, davon ca. 34.000 mit einzelverknüpften Digitalisaten, recherchierbar. An der Bereinigung der Altdatensatzeinträge und dem Aufbau sinnvoller Thesauri wird permanent gearbeitet.

Der Landesrechnungshof hinterfragt die Sinnhaftigkeit eines Archives am Joanneum. Wieder einmal ist es an der Institution, seit 2008 geleitet von Elke Murlasits, ihre Identität und Existenz zu begründen. Dies passiert in Form eines Konzeptes, basierend auf einem Papier von 2007. Aus dem Bild- und Tonarchiv werden die Multimedialen Sammlungen.

Im Zuge des von der Steiermärkischen Landesregierung beschlossenen Reformbudgets in den Jahren 2011 und 2012 muss das Universalmuseum Joanneum insgesamt 4,3 Millionen Euro einsparen. Die finanziellen Einschnitte machten weitreichende Maßnahmen, u. a. im Bereich der Organisationsstruktur notwendig: Die Multimedialen Sammlungen werden mit der Volkskunde zur Abteilung Alltagskultur.

Nach 40 Jahren Unterbringung im Palais Attems übersiedeln die Multimedialen Sammlungen in das Joanneumsviertel, ausgestattet mit einem Klimadepot (4° C und 17° C), einer Medienrestaurierwerkstätte und einer Fotodigitalisierungsstelle.
Auf der Jahrestagung der Medienarchive Austria (maa) „museum multimedial.

Audiovisionäre Traditionen in aktuellen Kontexten“ diskutieren internationale Expertinnen und Experten die spezielle Situation audiovisueller Museen sowie Strategien analoger und digitaler Langzeitarchivierung.

Die schrittweise Übersiedlung der Multimedialen Sammlungen an den neuen Standort im Joanneumsviertel wird mit 2014 abgeschlossen.

erfolgt die Neuordnung der Depots (Monitoring der Fotonegativsammlung, Separierung der Negativbestände aus Celluloseacetat und -nitrat vom übrigen Sammlungsgut), die schrittweise Sichtung, Digitalisierung, Restaurierung und Archivierung der Fotonegativsammlung sowie präventivkonservatorische Maßnahmen für einzelne Bestände.